山东白癜风医院 http://pf.39.net/bdfyy/bdflx/171107/5824581.html博淼导读
膀胱癌(BCa)是泌尿系统最常见的恶性肿瘤,频繁的检查以及检查手段使得病人们的治疗费用高昂。
目前膀胱癌的检测和监测方法多为侵袭性、敏感性和特异性欠佳,特别是在早期的、较小的、残留肿瘤。
我们仍然缺乏有效的手段来评估患者是否有残余肿瘤。因此,迫切需要发展有效的方法来发现早期的、微小的、残留的和复发的肿瘤,从而改善疾病的管理。
众所周知,尿液被认为是诊断膀胱癌的最佳非侵袭性样本。而白细胞在泌尿系统疾病的尿液中较为常见,是鉴别良恶性疾病的干扰因子。作者开发了一种新的检测尿液肿瘤DNA甲基化的方法,在多个基因组区域的质量阵列,称为utMeMA。并对该诊断方法的性能进行了分析,并与尿液细胞学和FISH进行了比较。
博淼生物有着近10年的DNA甲基化技术服务历程,参与科研项目超千个,在EWAS整体方案设计方面更具有特色、创新经验,尤其在EWAS后续靶向位点的深度优化环节更具硬核实力,属于公司绝对品牌服务。博淼生物可提供服务内容包括经典的EWAS研究、EWAS多组学整合研究、靶向区域甲基化位点绝对定量研究。
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原文:UrineDNAmethylationassayenablesearlydetectionandrecurrencemonitoringforbladdercancer
时间:/8/20
期刊:J.Clin.Invest
IF:11.
方案剖析
样本设计:
在Trainingstage中,从SYSMH招募了例尿路上皮癌患者、12名健康参与者和名非癌症对照者,时间为年6月至年5月。
在Validationstage中,从5家医院纳入了名尿路上皮癌患者和66名非癌症对照组,时间为年8月至年12月。
在Surveillancecohort中,纳入了来自SYSMH的38名肿瘤复发患者和43名无复发患者。
检测技术:
AnchorIRISTMtargetedmethylationsequencing
MethylationanalysisbyMALDI-TOF-MS(iPLEXMethylation)
数据分析方法:
BivariateCholeskymodel;randomeffectsregressionmodels;Enrichmentanalyses;Bivariatebiometricaltwinmodel;Multi-levelregressionmodels;skew-normalanalyses
结论分享:
1.DiscoveryofDNAmethylationmarkerstodistinguishbladdercancerfromnormaltissue
我们确定了26个在肿瘤中显示高且稳定的甲基化标记,但在正常组织和白细胞中仍然处于非常低的水平。这些数据表明,DNA个甲基化标记可以用来区分BCa。
2.DevelopmentofanovelurineDNAmethylationassayforbladdercancerdetection
为了验证26种标记物是否可以用于区分BCa和正常组织,我们使用utMeMA检测21对BCa和NATs以及18个匹配的尿液样本的甲基化水平。
结果表明,使用utMeMA,尿液DNA甲基化可以代表癌组织甲基化水平,23个标记可以作为BCa的诊断标记。
3.Constructionandvalidationofurinediagnosticmodeltodetectbladdercancerinthreecohortsbyusing2markers.
用utMeMA分析了23个标记的甲基化状态,并使用最小绝对收缩和选择算子(LASSO)进行标记选择和模型开发。我们得到了一个表现良好的模型,该模型只包含两个CpG标记(cg和cg)。为了进一步评估诊断模型在临床应用中的表现,进行了一项前瞻性、多中心、盲法研究。实验结论得出,该模型在BCa的检测中显示出高灵敏度和强诊断能力。
4.TheperformanceofutMeMAtodiagnosebladdercancerin